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上海信帆生物:科學(xué)家實(shí)現(xiàn)玉米單細(xì)胞測(cè)序

更新時(shí)間:2015-05-26   點(diǎn)擊次數(shù):1188次

日前,華中農(nóng)業(yè)大學(xué)作物遺傳改良國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室教授嚴(yán)建兵團(tuán)隊(duì)實(shí)現(xiàn)了玉米單細(xì)胞測(cè)序。相關(guān)成果發(fā)布在《自然—通訊》上。

四分體是一次細(xì)胞減數(shù)分裂后的直接產(chǎn)物,是遺傳重組分析的理想材料。分離四分體的四個(gè)小孢子并進(jìn)行單細(xì)胞基因型分析是研究遺傳重組機(jī)制的*方案,盡管目前動(dòng)物單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)較為成熟,但在植物中,由于細(xì)胞壁的存在,讓單細(xì)胞DNA難以獲取,致使這一研究舉步維艱。 面對(duì)這一挑戰(zhàn),嚴(yán)建兵團(tuán)隊(duì)通過對(duì)玉米24個(gè)四分體96個(gè)小孢子的全基因組低通量測(cè)序分析,獲得了近60萬高質(zhì)量的SNP標(biāo)記,構(gòu)建了接近單堿基水平的重組圖譜,準(zhǔn)確計(jì)算出玉米一個(gè)細(xì)胞一次減數(shù)分裂平均發(fā)生重組交換的次數(shù),定位了多個(gè)重組熱點(diǎn)區(qū)域。該研究證實(shí)了在植物中存在較強(qiáng)的重組負(fù)干涉和復(fù)雜的染色單體干涉、環(huán)境因素顯著影響重組頻率等重要遺傳學(xué)現(xiàn)象。

專家指出,該技術(shù)不但可以應(yīng)用于其他植物的單細(xì)胞測(cè)序研究,同時(shí)也是玉米重組規(guī)律的新認(rèn)識(shí),并豐富了遺傳學(xué)理論,為作物的遺傳育種提供了有價(jià)值的信息。

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